随着公祭伏羲活动的恢复，农历正月的春祭伏羲典礼和农历七月的秋祭伏羲活动也随之恢复，仪礼基本同晚清。 民祭活动在政府支持与指导下，由天水市民间祭祀伏羲协会和民间组织“上元会”具体组织实施，以太牢之礼祭祀。 在仪程和礼仪上基本保留了清代的历史传统。 春祭从正月十三日开始，十四日民众进香，十五日出榜，十六日正祭，十七日送神。 正月十六日相传为伏羲的诞辰日，这一天的祭祀仪程为： 一、行初献礼。 （1）上香明烛，化表，跪行三叩首礼；（2）击鼓鸣钟，鸣炮奏乐；（3）献三牲，献毛血。 二、行亚献礼。 （1）敬酒、献酒、奠酒；（2）献匙箸，献三牲，进祝文，献祝文；（3）献围盘，献糕点，献鲜果，分肴； 三、行终献礼。 （1）上香化表，恭读祝文，焚祝文；（2）献茶、奠茶，行三叩首礼；（3）起立互拜，瞻仰圣像。 秋祭活动每年农历七月十八日开始，至二十日结束，为期三天。 相传农历七月十九日为伏羲逝世纪念日。 十八日举行迎神、迎圣水、出榜文仪式；十九日举行迎献饭、行初献礼、亚献礼、终献礼仪式；二十日送神、送圣水、焚榜文。

民祭活动期间，伏羲庙内举办丰富多样的民俗活动，其中的开山攒神、灯会、灸红纸人、戏剧公演、舞龙舞狮表演、羊皮鼓表演、夹板表演等活动热闹非凡。 天水及其周边地区的民众倾城而出，成为一项全民参与的民俗文化活动。